

Situata a fianco del Palazzo del Vicario, la Chiesa di San Tommaso e San prospero è la più antica del Castello di Certaldo, risale infatti ai primi del XIII secolo.
Inizialmente dipendeva dalla Pieve di San Lazzaro a Lucardo, infatti di fronte alla chiesa si trova la Torre dei Lucardesi.
Al suo interno insieme ad alcuni affreschi del 1400, è custodito il "Tabernacolo dei Giustiziati" affrescato dal Benozzo Bozzoli, famoso anche per aver realizzato altri affreschi in Toscana e in Valdelsa come in particolare quelli e custoditi presso il Centro Culturale Comunale di Castelfiorentino. Il Tabernacolo dei Giustiziati serviva come ultima sosta di preghiera dei condannati a morte, prima di essere condotti nel carcere del Palazzo del Vicario.
